Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVAQ9NVD7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms