Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms