Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms