Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms