Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms