Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms