Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms