Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMYD3Q9H7B4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms