Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms