Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms