Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDT1Q9H211 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDT1Q9H211 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms