Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL4Q9C0H6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms