Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD1Q9BXT4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms