Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms