Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms