Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MESP1Q9BRJ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms