Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms