Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIK3R4Q99570 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIK3R4Q99570 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms