Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms