Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms