Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAP3Q96P50 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms