Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms