Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC7Q96M83 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms