Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms