Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PRAC1Q96KF2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms