Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2Q96I99 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms