Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM17Q96I25 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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