Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NEIL1Q96FI4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms