Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF34Q969K3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms