Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms