Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms