Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf3Q8WVX3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms