Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO3Q8TAP4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO3Q8TAP4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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