Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC33Q8N5R6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms