Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC65Q8IXS2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC65Q8IXS2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms