Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms