Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms