Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms