Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms