Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SV2BQ7L1I2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms