Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KNDC1Q76NI1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms