Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGMBQ6NW40 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms