Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms