Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCSD1Q6JBY9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.1 ms