Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WSCD1Q658N2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WSCD1Q658N2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms