Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP9Q5VTM2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP9Q5VTM2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms