Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRIP1Q5VSL9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms