Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RSPH4AQ5TD94 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RSPH4AQ5TD94 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms