Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF542PQ5EBM4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms