Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms